Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNP2Q05952 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNP2Q05952 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNP2Q05952 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms