Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OCA2Q04671 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OCA2Q04671 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OCA2Q04671 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
OCA2Q04671 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms