Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TAP1Q03518 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TAP1Q03518 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAP1Q03518 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TAP1Q03518 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TAP1Q03518 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TAP1Q03518 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TAP1Q03518 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAP1Q03518 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TAP1Q03518 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TAP1Q03518 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TAP1Q03518 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TAP1Q03518 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TAP1Q03518 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TAP1Q03518 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAP1Q03518 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms