Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSG1Q02413 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG1Q02413 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG1Q02413 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSG1Q02413 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSG1Q02413 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DSG1Q02413 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DSG1Q02413 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms