Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLDN10P78369 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLDN10P78369 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLDN10P78369 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLDN10P78369 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLDN10P78369 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLDN10P78369 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLDN10P78369 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms