Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RACK1P63244 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RACK1P63244 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RACK1P63244 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RACK1P63244 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RACK1P63244 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RACK1P63244 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RACK1P63244 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RACK1P63244 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RACK1P63244 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RACK1P63244 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RACK1P63244 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RACK1P63244 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RACK1P63244 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RACK1P63244 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RACK1P63244 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RACK1P63244 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RACK1P63244 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RACK1P63244 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RACK1P63244 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RACK1P63244 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RACK1P63244 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RACK1P63244 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RACK1P63244 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RACK1P63244 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RACK1P63244 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RACK1P63244 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RACK1P63244 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RACK1P63244 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RACK1P63244 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RACK1P63244 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RACK1P63244 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RACK1P63244 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RACK1P63244 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RACK1P63244 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RACK1P63244 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RACK1P63244 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RACK1P63244 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RACK1P63244 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RACK1P63244 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RACK1P63244 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RACK1P63244 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RACK1P63244 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RACK1P63244 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RACK1P63244 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RACK1P63244 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RACK1P63244 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RACK1P63244 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RACK1P63244 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RACK1P63244 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RACK1P63244 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RACK1P63244 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RACK1P63244 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RACK1P63244 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RACK1P63244 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RACK1P63244 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RACK1P63244 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RACK1P63244 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RACK1P63244 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RACK1P63244 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RACK1P63244 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RACK1P63244 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RACK1P63244 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RACK1P63244 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RACK1P63244 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RACK1P63244 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RACK1P63244 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RACK1P63244 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RACK1P63244 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RACK1P63244 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RACK1P63244 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RACK1P63244 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RACK1P63244 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RACK1P63244 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RACK1P63244 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RACK1P63244 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RACK1P63244 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RACK1P63244 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RACK1P63244 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RACK1P63244 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RACK1P63244 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RACK1P63244 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RACK1P63244 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RACK1P63244 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RACK1P63244 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RACK1P63244 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms