Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA52P62987 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA52P62987 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA52P62987 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA52P62987 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA52P62987 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA52P62987 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA52P62987 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA52P62987 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA52P62987 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA52P62987 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA52P62987 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA52P62987 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA52P62987 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA52P62987 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA52P62987 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA52P62987 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBA52P62987 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA52P62987 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA52P62987 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA52P62987 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA52P62987 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA52P62987 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA52P62987 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA52P62987 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA52P62987 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA52P62987 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA52P62987 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA52P62987 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA52P62987 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA52P62987 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA52P62987 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA52P62987 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA52P62987 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA52P62987 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA52P62987 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA52P62987 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA52P62987 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA52P62987 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA52P62987 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA52P62987 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA52P62987 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBA52P62987 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA52P62987 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA52P62987 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA52P62987 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA52P62987 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA52P62987 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA52P62987 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA52P62987 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA52P62987 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA52P62987 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA52P62987 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA52P62987 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA52P62987 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA52P62987 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA52P62987 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA52P62987 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA52P62987 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA52P62987 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA52P62987 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA52P62987 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA52P62987 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA52P62987 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA52P62987 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA52P62987 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA52P62987 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA52P62987 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA52P62987 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBA52P62987 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBA52P62987 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA52P62987 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBA52P62987 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA52P62987 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA52P62987 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA52P62987 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA52P62987 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBA52P62987 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA52P62987 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA52P62987 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA52P62987 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA52P62987 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA52P62987 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA52P62987 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA52P62987 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA52P62987 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA52P62987 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA52P62987 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA52P62987 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA52P62987 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA52P62987 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA52P62987 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBA52P62987 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA52P62987 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA52P62987 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA52P62987 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA52P62987 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA52P62987 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA52P62987 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA52P62987 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.7 ms