Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMC6P62333 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMC6P62333 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMC6P62333 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMC6P62333 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSMC6P62333 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC6P62333 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms