Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-16P61578 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-16P61578 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-16P61578 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-16P61578 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-16P61578 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-16P61578 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-16P61578 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-16P61578 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-16P61578 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-16P61578 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-16P61578 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-16P61578 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
ERVK-16P61578 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-16P61578 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-16P61578 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-16P61578 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-16P61578 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-16P61578 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-16P61578 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-16P61578 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-16P61578 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-16P61578 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-16P61578 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-16P61578 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms