Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2MP61081 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2MP61081 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2MP61081 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2MP61081 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2MP61081 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2MP61081 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2MP61081 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2MP61081 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2MP61081 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2MP61081 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2MP61081 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2MP61081 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2MP61081 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2MP61081 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms