Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTENP60484 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTENP60484 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTENP60484 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTENP60484 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTENP60484 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTENP60484 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTENP60484 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTENP60484 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTENP60484 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTENP60484 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTENP60484 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTENP60484 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTENP60484 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTENP60484 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTENP60484 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTENP60484 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTENP60484 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTENP60484 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTENP60484 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTENP60484 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTENP60484 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTENP60484 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTENP60484 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTENP60484 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTENP60484 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTENP60484 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTENP60484 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTENP60484 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTENP60484 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTENP60484 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTENP60484 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTENP60484 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTENP60484 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTENP60484 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTENP60484 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTENP60484 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTENP60484 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTENP60484 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTENP60484 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTENP60484 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTENP60484 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTENP60484 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTENP60484 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTENP60484 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTENP60484 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTENP60484 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTENP60484 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTENP60484 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTENP60484 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTENP60484 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTENP60484 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTENP60484 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTENP60484 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTENP60484 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTENP60484 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTENP60484 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTENP60484 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTENP60484 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTENP60484 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTENP60484 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTENP60484 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTENP60484 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTENP60484 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTENP60484 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTENP60484 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTENP60484 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTENP60484 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTENP60484 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTENP60484 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTENP60484 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTENP60484 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTENP60484 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTENP60484 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTENP60484 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTENP60484 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTENP60484 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTENP60484 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTENP60484 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTENP60484 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTENP60484 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTENP60484 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTENP60484 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTENP60484 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTENP60484 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTENP60484 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTENP60484 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTENP60484 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTENP60484 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTENP60484 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTENP60484 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTENP60484 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTENP60484 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTENP60484 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTENP60484 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTENP60484 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTENP60484 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTENP60484 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTENP60484 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTENP60484 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms