Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC26A5P58743 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC26A5P58743 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC26A5P58743 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC26A5P58743 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC26A5P58743 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC26A5P58743 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC26A5P58743 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC26A5P58743 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC26A5P58743 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC26A5P58743 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC26A5P58743 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC26A5P58743 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC26A5P58743 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC26A5P58743 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC26A5P58743 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC26A5P58743 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC26A5P58743 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC26A5P58743 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms