Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP107P57740 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP107P57740 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP107P57740 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP107P57740 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP107P57740 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP107P57740 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP107P57740 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP107P57740 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP107P57740 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP107P57740 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP107P57740 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP107P57740 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP107P57740 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP107P57740 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP107P57740 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP107P57740 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP107P57740 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP107P57740 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP107P57740 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP107P57740 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP107P57740 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP107P57740 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP107P57740 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP107P57740 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP107P57740 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP107P57740 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP107P57740 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP107P57740 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP107P57740 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP107P57740 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP107P57740 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP107P57740 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP107P57740 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP107P57740 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP107P57740 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP107P57740 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP107P57740 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP107P57740 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP107P57740 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP107P57740 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP107P57740 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP107P57740 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP107P57740 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP107P57740 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP107P57740 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP107P57740 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP107P57740 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP107P57740 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP107P57740 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP107P57740 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP107P57740 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP107P57740 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP107P57740 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP107P57740 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP107P57740 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP107P57740 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP107P57740 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP107P57740 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP107P57740 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP107P57740 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP107P57740 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP107P57740 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP107P57740 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP107P57740 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP107P57740 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP107P57740 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP107P57740 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP107P57740 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP107P57740 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP107P57740 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP107P57740 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP107P57740 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP107P57740 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP107P57740 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP107P57740 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP107P57740 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP107P57740 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP107P57740 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP107P57740 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP107P57740 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP107P57740 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP107P57740 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP107P57740 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP107P57740 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP107P57740 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP107P57740 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP107P57740 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP107P57740 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP107P57740 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP107P57740 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP107P57740 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP107P57740 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP107P57740 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP107P57740 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP107P57740 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP107P57740 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP107P57740 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP107P57740 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP107P57740 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms