Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRPF1P55201 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRPF1P55201 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRPF1P55201 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRPF1P55201 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
BRPF1P55201 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
BRPF1P55201 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
BRPF1P55201 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRPF1P55201 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
BRPF1P55201 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRPF1P55201 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRPF1P55201 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRPF1P55201 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
BRPF1P55201 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BRPF1P55201 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms