Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCCSP53701 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCCSP53701 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCCSP53701 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCCSP53701 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCCSP53701 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCCSP53701 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCCSP53701 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCCSP53701 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCCSP53701 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCCSP53701 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCCSP53701 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCCSP53701 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCCSP53701 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCCSP53701 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCCSP53701 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HCCSP53701 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCCSP53701 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCCSP53701 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCCSP53701 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCCSP53701 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCCSP53701 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCCSP53701 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCCSP53701 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCCSP53701 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCCSP53701 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCCSP53701 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCCSP53701 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCCSP53701 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCCSP53701 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCCSP53701 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCCSP53701 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCCSP53701 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HCCSP53701 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HCCSP53701 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCCSP53701 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCCSP53701 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCCSP53701 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCCSP53701 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCCSP53701 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCCSP53701 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCCSP53701 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCCSP53701 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCCSP53701 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCCSP53701 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCCSP53701 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCCSP53701 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCCSP53701 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCCSP53701 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCCSP53701 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCCSP53701 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCCSP53701 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCCSP53701 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCCSP53701 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCCSP53701 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCCSP53701 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCCSP53701 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCCSP53701 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCCSP53701 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCCSP53701 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCCSP53701 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCCSP53701 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCCSP53701 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCCSP53701 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HCCSP53701 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCCSP53701 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCCSP53701 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCCSP53701 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCCSP53701 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCCSP53701 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCCSP53701 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCCSP53701 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCCSP53701 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCCSP53701 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCCSP53701 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCCSP53701 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HCCSP53701 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCCSP53701 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCCSP53701 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCCSP53701 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCCSP53701 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCCSP53701 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCCSP53701 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCCSP53701 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCCSP53701 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCCSP53701 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCCSP53701 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCCSP53701 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCCSP53701 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCCSP53701 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCCSP53701 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCCSP53701 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCCSP53701 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCCSP53701 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCCSP53701 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCCSP53701 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCCSP53701 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCCSP53701 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCCSP53701 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCCSP53701 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms