Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E1P51965 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2E1P51965 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E1P51965 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2E1P51965 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E1P51965 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2E1P51965 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2E1P51965 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2E1P51965 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E1P51965 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E1P51965 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E1P51965 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E1P51965 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2E1P51965 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E1P51965 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2E1P51965 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E1P51965 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E1P51965 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2E1P51965 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E1P51965 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E1P51965 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E1P51965 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E1P51965 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2E1P51965 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E1P51965 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E1P51965 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2E1P51965 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2E1P51965 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2E1P51965 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2E1P51965 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2E1P51965 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2E1P51965 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2E1P51965 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms