Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A2P50993 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A2P50993 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP1A2P50993 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP1A2P50993 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP1A2P50993 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP1A2P50993 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP1A2P50993 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP1A2P50993 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP1A2P50993 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms