Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTSOP43234 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTSOP43234 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTSOP43234 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTSOP43234 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTSOP43234 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTSOP43234 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTSOP43234 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTSOP43234 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTSOP43234 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTSOP43234 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTSOP43234 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTSOP43234 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTSOP43234 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTSOP43234 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTSOP43234 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTSOP43234 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSOP43234 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTSOP43234 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSOP43234 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTSOP43234 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSOP43234 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSOP43234 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTSOP43234 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTSOP43234 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTSOP43234 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSOP43234 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSOP43234 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTSOP43234 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSOP43234 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSOP43234 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSOP43234 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSOP43234 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTSOP43234 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTSOP43234 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTSOP43234 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTSOP43234 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTSOP43234 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTSOP43234 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTSOP43234 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTSOP43234 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTSOP43234 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTSOP43234 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTSOP43234 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CTSOP43234 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTSOP43234 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTSOP43234 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTSOP43234 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTSOP43234 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTSOP43234 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTSOP43234 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTSOP43234 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTSOP43234 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTSOP43234 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTSOP43234 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTSOP43234 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTSOP43234 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTSOP43234 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTSOP43234 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTSOP43234 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTSOP43234 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTSOP43234 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTSOP43234 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTSOP43234 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTSOP43234 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTSOP43234 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTSOP43234 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTSOP43234 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTSOP43234 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTSOP43234 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTSOP43234 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTSOP43234 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTSOP43234 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CTSOP43234 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTSOP43234 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTSOP43234 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTSOP43234 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTSOP43234 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CTSOP43234 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTSOP43234 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTSOP43234 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTSOP43234 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTSOP43234 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSOP43234 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSOP43234 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSOP43234 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSOP43234 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTSOP43234 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTSOP43234 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTSOP43234 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSOP43234 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSOP43234 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSOP43234 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSOP43234 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTSOP43234 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTSOP43234 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTSOP43234 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CTSOP43234 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTSOP43234 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSOP43234 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms