Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DCCP43146 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DCCP43146 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DCCP43146 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DCCP43146 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DCCP43146 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
DCCP43146 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
DCCP43146 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DCCP43146 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DCCP43146 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DCCP43146 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
DCCP43146 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
DCCP43146 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DCCP43146 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCCP43146 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DCCP43146 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCCP43146 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCCP43146 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
DCCP43146 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DCCP43146 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCCP43146 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCCP43146 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
DCCP43146 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCCP43146 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCCP43146 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DCCP43146 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DCCP43146 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DCCP43146 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
DCCP43146 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
DCCP43146 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DCCP43146 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
DCCP43146 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DCCP43146 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCCP43146 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCCP43146 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCCP43146 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
DCCP43146 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DCCP43146 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCCP43146 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
DCCP43146 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCCP43146 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
DCCP43146 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
DCCP43146 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DCCP43146 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
DCCP43146 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DCCP43146 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
DCCP43146 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
DCCP43146 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
DCCP43146 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
DCCP43146 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
DCCP43146 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
DCCP43146 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
DCCP43146 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
DCCP43146 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DCCP43146 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DCCP43146 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DCCP43146 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DCCP43146 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
DCCP43146 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
DCCP43146 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
DCCP43146 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
DCCP43146 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
DCCP43146 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
DCCP43146 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
DCCP43146 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
DCCP43146 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
DCCP43146 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
DCCP43146 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
DCCP43146 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
DCCP43146 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
DCCP43146 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
DCCP43146 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
DCCP43146 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
DCCP43146 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
DCCP43146 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
DCCP43146 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
DCCP43146 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
DCCP43146 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
DCCP43146 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DCCP43146 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DCCP43146 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
DCCP43146 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCCP43146 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCCP43146 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCCP43146 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCCP43146 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCCP43146 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCCP43146 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCCP43146 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCCP43146 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCCP43146 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCCP43146 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCCP43146 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCCP43146 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
DCCP43146 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
DCCP43146 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCCP43146 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCCP43146 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DCCP43146 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DCCP43146 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms