Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP42356 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PI4KAP42356 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PI4KAP42356 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PI4KAP42356 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4KAP42356 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PI4KAP42356 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PI4KAP42356 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PI4KAP42356 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PI4KAP42356 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PI4KAP42356 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PI4KAP42356 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PI4KAP42356 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PI4KAP42356 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4KAP42356 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PI4KAP42356 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PI4KAP42356 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PI4KAP42356 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PI4KAP42356 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PI4KAP42356 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PI4KAP42356 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PI4KAP42356 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PI4KAP42356 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PI4KAP42356 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PI4KAP42356 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315.2 ms