Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VHLP40337 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VHLP40337 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VHLP40337 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VHLP40337 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VHLP40337 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VHLP40337 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VHLP40337 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VHLP40337 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VHLP40337 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VHLP40337 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VHLP40337 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VHLP40337 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VHLP40337 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VHLP40337 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VHLP40337 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VHLP40337 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VHLP40337 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VHLP40337 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VHLP40337 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VHLP40337 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VHLP40337 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VHLP40337 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VHLP40337 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VHLP40337 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VHLP40337 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VHLP40337 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VHLP40337 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VHLP40337 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VHLP40337 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VHLP40337 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VHLP40337 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VHLP40337 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VHLP40337 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VHLP40337 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VHLP40337 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VHLP40337 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VHLP40337 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VHLP40337 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VHLP40337 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VHLP40337 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VHLP40337 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VHLP40337 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VHLP40337 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VHLP40337 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VHLP40337 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VHLP40337 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VHLP40337 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VHLP40337 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VHLP40337 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VHLP40337 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VHLP40337 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VHLP40337 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VHLP40337 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VHLP40337 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VHLP40337 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VHLP40337 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VHLP40337 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VHLP40337 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VHLP40337 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VHLP40337 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VHLP40337 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VHLP40337 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VHLP40337 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VHLP40337 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VHLP40337 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VHLP40337 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VHLP40337 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VHLP40337 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VHLP40337 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VHLP40337 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VHLP40337 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VHLP40337 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VHLP40337 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VHLP40337 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VHLP40337 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VHLP40337 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VHLP40337 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VHLP40337 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VHLP40337 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VHLP40337 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VHLP40337 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VHLP40337 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VHLP40337 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VHLP40337 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VHLP40337 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VHLP40337 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VHLP40337 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VHLP40337 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VHLP40337 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VHLP40337 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VHLP40337 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VHLP40337 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VHLP40337 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VHLP40337 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VHLP40337 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VHLP40337 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VHLP40337 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VHLP40337 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VHLP40337 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms