Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCNN1AP37088 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1AP37088 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1AP37088 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1AP37088 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1AP37088 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1AP37088 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1AP37088 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCNN1AP37088 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCNN1AP37088 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCNN1AP37088 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCNN1AP37088 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCNN1AP37088 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCNN1AP37088 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCNN1AP37088 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCNN1AP37088 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCNN1AP37088 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCNN1AP37088 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCNN1AP37088 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCNN1AP37088 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCNN1AP37088 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCNN1AP37088 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1AP37088 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1AP37088 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCNN1AP37088 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SCNN1AP37088 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCNN1AP37088 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCNN1AP37088 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms