Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HNF1BP35680 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HNF1BP35680 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HNF1BP35680 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HNF1BP35680 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HNF1BP35680 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HNF1BP35680 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HNF1BP35680 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms