Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RFC2P35250 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RFC2P35250 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFC2P35250 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFC2P35250 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFC2P35250 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFC2P35250 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFC2P35250 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFC2P35250 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFC2P35250 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFC2P35250 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFC2P35250 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFC2P35250 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RFC2P35250 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFC2P35250 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFC2P35250 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFC2P35250 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFC2P35250 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFC2P35250 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFC2P35250 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFC2P35250 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFC2P35250 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFC2P35250 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFC2P35250 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFC2P35250 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFC2P35250 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RFC2P35250 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RFC2P35250 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFC2P35250 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFC2P35250 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFC2P35250 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFC2P35250 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFC2P35250 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFC2P35250 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFC2P35250 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFC2P35250 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFC2P35250 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFC2P35250 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFC2P35250 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RFC2P35250 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFC2P35250 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RFC2P35250 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFC2P35250 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFC2P35250 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFC2P35250 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFC2P35250 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFC2P35250 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFC2P35250 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFC2P35250 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RFC2P35250 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFC2P35250 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RFC2P35250 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFC2P35250 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFC2P35250 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFC2P35250 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFC2P35250 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFC2P35250 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFC2P35250 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFC2P35250 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFC2P35250 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RFC2P35250 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFC2P35250 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFC2P35250 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFC2P35250 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFC2P35250 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RFC2P35250 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFC2P35250 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFC2P35250 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFC2P35250 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFC2P35250 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
RFC2P35250 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RFC2P35250 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RFC2P35250 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFC2P35250 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFC2P35250 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFC2P35250 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFC2P35250 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFC2P35250 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFC2P35250 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RFC2P35250 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFC2P35250 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC2P35250 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC2P35250 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC2P35250 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC2P35250 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC2P35250 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC2P35250 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC2P35250 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFC2P35250 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFC2P35250 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RFC2P35250 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFC2P35250 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFC2P35250 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFC2P35250 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFC2P35250 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC2P35250 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC2P35250 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC2P35250 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC2P35250 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFC2P35250 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms