Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC8A1P32418 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC8A1P32418 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC8A1P32418 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC8A1P32418 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms