Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC6A4P31645 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC6A4P31645 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC6A4P31645 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC6A4P31645 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC6A4P31645 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC6A4P31645 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms