Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR1EP28566 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTR1EP28566 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR1EP28566 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR1EP28566 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
HTR1EP28566 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms