Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLD1P28340 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLD1P28340 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLD1P28340 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLD1P28340 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLD1P28340 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLD1P28340 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
POLD1P28340 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLD1P28340 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLD1P28340 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLD1P28340 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLD1P28340 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLD1P28340 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLD1P28340 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLD1P28340 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
POLD1P28340 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLD1P28340 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLD1P28340 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLD1P28340 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLD1P28340 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
POLD1P28340 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLD1P28340 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
POLD1P28340 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLD1P28340 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
POLD1P28340 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
POLD1P28340 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
POLD1P28340 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
POLD1P28340 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
POLD1P28340 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
POLD1P28340 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
POLD1P28340 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
POLD1P28340 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
POLD1P28340 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLD1P28340 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLD1P28340 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLD1P28340 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
POLD1P28340 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
POLD1P28340 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
POLD1P28340 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
POLD1P28340 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
POLD1P28340 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
POLD1P28340 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
POLD1P28340 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLD1P28340 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLD1P28340 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
POLD1P28340 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
POLD1P28340 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLD1P28340 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLD1P28340 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLD1P28340 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLD1P28340 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLD1P28340 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLD1P28340 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLD1P28340 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLD1P28340 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLD1P28340 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
POLD1P28340 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLD1P28340 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLD1P28340 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLD1P28340 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLD1P28340 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
POLD1P28340 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
POLD1P28340 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLD1P28340 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLD1P28340 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLD1P28340 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLD1P28340 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLD1P28340 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLD1P28340 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLD1P28340 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLD1P28340 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLD1P28340 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLD1P28340 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLD1P28340 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLD1P28340 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLD1P28340 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLD1P28340 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLD1P28340 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLD1P28340 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLD1P28340 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLD1P28340 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLD1P28340 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLD1P28340 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
POLD1P28340 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLD1P28340 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLD1P28340 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLD1P28340 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLD1P28340 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLD1P28340 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLD1P28340 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLD1P28340 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLD1P28340 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLD1P28340 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLD1P28340 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLD1P28340 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLD1P28340 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLD1P28340 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLD1P28340 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLD1P28340 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLD1P28340 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms