Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA4P25789 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMA4P25789 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA4P25789 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA4P25789 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA4P25789 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms