Protein–RNA interactions for Protein: P23528

CFL1, Cofilin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFL1P23528 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFL1P23528 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFL1P23528 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFL1P23528 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFL1P23528 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFL1P23528 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFL1P23528 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFL1P23528 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFL1P23528 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFL1P23528 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFL1P23528 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFL1P23528 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFL1P23528 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFL1P23528 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFL1P23528 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFL1P23528 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFL1P23528 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFL1P23528 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFL1P23528 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CFL1P23528 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFL1P23528 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CFL1P23528 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFL1P23528 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFL1P23528 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFL1P23528 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFL1P23528 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFL1P23528 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFL1P23528 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFL1P23528 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFL1P23528 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CFL1P23528 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFL1P23528 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFL1P23528 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFL1P23528 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFL1P23528 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFL1P23528 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFL1P23528 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFL1P23528 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFL1P23528 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFL1P23528 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFL1P23528 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFL1P23528 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFL1P23528 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CFL1P23528 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFL1P23528 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFL1P23528 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFL1P23528 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFL1P23528 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFL1P23528 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFL1P23528 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFL1P23528 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFL1P23528 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFL1P23528 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFL1P23528 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFL1P23528 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFL1P23528 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFL1P23528 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFL1P23528 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFL1P23528 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFL1P23528 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFL1P23528 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFL1P23528 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFL1P23528 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFL1P23528 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFL1P23528 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFL1P23528 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFL1P23528 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFL1P23528 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFL1P23528 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFL1P23528 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFL1P23528 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFL1P23528 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFL1P23528 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFL1P23528 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFL1P23528 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFL1P23528 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFL1P23528 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFL1P23528 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFL1P23528 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFL1P23528 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFL1P23528 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFL1P23528 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFL1P23528 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFL1P23528 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFL1P23528 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFL1P23528 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFL1P23528 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFL1P23528 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFL1P23528 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFL1P23528 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFL1P23528 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFL1P23528 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFL1P23528 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFL1P23528 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFL1P23528 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms