Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR4A1P22736 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NR4A1P22736 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A1P22736 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR4A1P22736 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms