Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD247P20963 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD247P20963 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD247P20963 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD247P20963 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD247P20963 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD247P20963 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD247P20963 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD247P20963 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD247P20963 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD247P20963 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD247P20963 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD247P20963 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD247P20963 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD247P20963 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD247P20963 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD247P20963 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD247P20963 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD247P20963 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD247P20963 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD247P20963 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD247P20963 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD247P20963 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD247P20963 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD247P20963 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD247P20963 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD247P20963 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD247P20963 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD247P20963 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD247P20963 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD247P20963 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD247P20963 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD247P20963 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD247P20963 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD247P20963 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD247P20963 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD247P20963 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD247P20963 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD247P20963 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD247P20963 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD247P20963 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD247P20963 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD247P20963 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD247P20963 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD247P20963 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD247P20963 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD247P20963 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD247P20963 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD247P20963 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD247P20963 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD247P20963 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD247P20963 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD247P20963 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD247P20963 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD247P20963 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD247P20963 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD247P20963 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD247P20963 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD247P20963 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD247P20963 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD247P20963 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CD247P20963 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD247P20963 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD247P20963 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD247P20963 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD247P20963 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD247P20963 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD247P20963 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD247P20963 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD247P20963 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD247P20963 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD247P20963 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD247P20963 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD247P20963 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD247P20963 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD247P20963 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD247P20963 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD247P20963 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD247P20963 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD247P20963 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CD247P20963 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD247P20963 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD247P20963 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD247P20963 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD247P20963 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD247P20963 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD247P20963 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD247P20963 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD247P20963 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD247P20963 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD247P20963 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD247P20963 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD247P20963 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD247P20963 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD247P20963 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD247P20963 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD247P20963 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD247P20963 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD247P20963 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD247P20963 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms