Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATF3P18847 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ATF3P18847 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ATF3P18847 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ATF3P18847 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATF3P18847 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATF3P18847 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATF3P18847 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
ATF3P18847 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATF3P18847 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATF3P18847 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATF3P18847 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATF3P18847 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATF3P18847 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATF3P18847 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATF3P18847 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
ATF3P18847 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATF3P18847 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATF3P18847 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATF3P18847 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATF3P18847 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATF3P18847 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATF3P18847 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATF3P18847 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATF3P18847 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATF3P18847 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATF3P18847 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ATF3P18847 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ATF3P18847 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATF3P18847 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATF3P18847 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATF3P18847 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATF3P18847 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATF3P18847 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATF3P18847 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ATF3P18847 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ATF3P18847 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ATF3P18847 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATF3P18847 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATF3P18847 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATF3P18847 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATF3P18847 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATF3P18847 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATF3P18847 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ATF3P18847 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATF3P18847 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATF3P18847 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATF3P18847 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATF3P18847 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ATF3P18847 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ATF3P18847 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ATF3P18847 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ATF3P18847 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATF3P18847 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATF3P18847 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATF3P18847 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATF3P18847 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
ATF3P18847 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
ATF3P18847 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ATF3P18847 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ATF3P18847 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATF3P18847 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATF3P18847 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ATF3P18847 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ATF3P18847 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ATF3P18847 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ATF3P18847 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ATF3P18847 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ATF3P18847 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ATF3P18847 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ATF3P18847 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATF3P18847 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATF3P18847 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATF3P18847 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATF3P18847 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ATF3P18847 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATF3P18847 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATF3P18847 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
ATF3P18847 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATF3P18847 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATF3P18847 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATF3P18847 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ATF3P18847 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ATF3P18847 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ATF3P18847 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ATF3P18847 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ATF3P18847 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ATF3P18847 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ATF3P18847 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ATF3P18847 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ATF3P18847 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ATF3P18847 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ATF3P18847 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATF3P18847 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATF3P18847 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATF3P18847 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATF3P18847 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATF3P18847 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATF3P18847 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATF3P18847 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms