Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DESP17661 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DESP17661 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DESP17661 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DESP17661 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DESP17661 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DESP17661 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DESP17661 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DESP17661 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DESP17661 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DESP17661 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DESP17661 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DESP17661 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DESP17661 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DESP17661 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DESP17661 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DESP17661 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DESP17661 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DESP17661 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DESP17661 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DESP17661 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DESP17661 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DESP17661 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DESP17661 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DESP17661 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DESP17661 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DESP17661 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DESP17661 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DESP17661 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DESP17661 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DESP17661 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DESP17661 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DESP17661 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DESP17661 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DESP17661 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DESP17661 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DESP17661 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DESP17661 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DESP17661 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DESP17661 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DESP17661 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DESP17661 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DESP17661 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
DESP17661 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DESP17661 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DESP17661 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DESP17661 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DESP17661 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DESP17661 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DESP17661 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DESP17661 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DESP17661 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DESP17661 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DESP17661 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DESP17661 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DESP17661 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DESP17661 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DESP17661 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DESP17661 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DESP17661 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DESP17661 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DESP17661 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DESP17661 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DESP17661 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DESP17661 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DESP17661 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DESP17661 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DESP17661 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DESP17661 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DESP17661 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DESP17661 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DESP17661 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DESP17661 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DESP17661 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DESP17661 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DESP17661 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DESP17661 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DESP17661 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DESP17661 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DESP17661 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DESP17661 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DESP17661 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DESP17661 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DESP17661 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DESP17661 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DESP17661 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DESP17661 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DESP17661 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DESP17661 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DESP17661 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DESP17661 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DESP17661 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DESP17661 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DESP17661 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DESP17661 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DESP17661 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DESP17661 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DESP17661 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DESP17661 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DESP17661 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms