Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYL4P12829 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYL4P12829 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYL4P12829 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYL4P12829 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYL4P12829 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYL4P12829 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYL4P12829 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYL4P12829 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYL4P12829 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYL4P12829 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYL4P12829 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYL4P12829 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYL4P12829 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYL4P12829 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYL4P12829 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYL4P12829 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYL4P12829 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYL4P12829 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL4P12829 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL4P12829 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL4P12829 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL4P12829 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL4P12829 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL4P12829 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL4P12829 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL4P12829 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYL4P12829 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MYL4P12829 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MYL4P12829 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYL4P12829 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYL4P12829 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MYL4P12829 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYL4P12829 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYL4P12829 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYL4P12829 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYL4P12829 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYL4P12829 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MYL4P12829 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYL4P12829 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYL4P12829 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYL4P12829 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYL4P12829 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYL4P12829 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL4P12829 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL4P12829 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL4P12829 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL4P12829 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL4P12829 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYL4P12829 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYL4P12829 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYL4P12829 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYL4P12829 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYL4P12829 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYL4P12829 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYL4P12829 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYL4P12829 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYL4P12829 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYL4P12829 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYL4P12829 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYL4P12829 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYL4P12829 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYL4P12829 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYL4P12829 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYL4P12829 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYL4P12829 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYL4P12829 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYL4P12829 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYL4P12829 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYL4P12829 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYL4P12829 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYL4P12829 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYL4P12829 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYL4P12829 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL4P12829 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL4P12829 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL4P12829 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL4P12829 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYL4P12829 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYL4P12829 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
MYL4P12829 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYL4P12829 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MYL4P12829 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYL4P12829 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYL4P12829 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYL4P12829 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYL4P12829 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYL4P12829 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYL4P12829 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYL4P12829 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYL4P12829 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYL4P12829 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYL4P12829 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYL4P12829 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MYL4P12829 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MYL4P12829 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYL4P12829 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYL4P12829 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL4P12829 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL4P12829 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms