Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TOP1P11387 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP1P11387 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TOP1P11387 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP1P11387 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TOP1P11387 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP1P11387 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TOP1P11387 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP1P11387 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP1P11387 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP1P11387 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TOP1P11387 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP1P11387 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TOP1P11387 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP1P11387 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP1P11387 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOP1P11387 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP1P11387 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TOP1P11387 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP1P11387 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP1P11387 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TOP1P11387 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP1P11387 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP1P11387 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP1P11387 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TOP1P11387 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP1P11387 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP1P11387 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TOP1P11387 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP1P11387 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOP1P11387 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP1P11387 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP1P11387 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOP1P11387 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP1P11387 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP1P11387 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOP1P11387 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP1P11387 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TOP1P11387 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOP1P11387 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP1P11387 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOP1P11387 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP1P11387 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOP1P11387 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP1P11387 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP1P11387 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TOP1P11387 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP1P11387 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TOP1P11387 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TOP1P11387 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TOP1P11387 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP1P11387 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOP1P11387 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP1P11387 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TOP1P11387 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP1P11387 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP1P11387 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP1P11387 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP1P11387 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP1P11387 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP1P11387 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP1P11387 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP1P11387 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP1P11387 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP1P11387 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP1P11387 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP1P11387 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TOP1P11387 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TOP1P11387 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP1P11387 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOP1P11387 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOP1P11387 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOP1P11387 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TOP1P11387 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TOP1P11387 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOP1P11387 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOP1P11387 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOP1P11387 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOP1P11387 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOP1P11387 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOP1P11387 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOP1P11387 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOP1P11387 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOP1P11387 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOP1P11387 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOP1P11387 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP1P11387 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP1P11387 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP1P11387 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP1P11387 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP1P11387 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP1P11387 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP1P11387 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP1P11387 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP1P11387 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOP1P11387 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP1P11387 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP1P11387 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP1P11387 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOP1P11387 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms