Protein–RNA interactions for Protein: P09132

SRP19, Signal recognition particle 19 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19P09132 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRP19P09132 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRP19P09132 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRP19P09132 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRP19P09132 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRP19P09132 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRP19P09132 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRP19P09132 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRP19P09132 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRP19P09132 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRP19P09132 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRP19P09132 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SRP19P09132 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRP19P09132 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRP19P09132 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRP19P09132 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRP19P09132 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRP19P09132 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRP19P09132 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP19P09132 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP19P09132 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP19P09132 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP19P09132 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRP19P09132 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP19P09132 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRP19P09132 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP19P09132 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP19P09132 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRP19P09132 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP19P09132 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP19P09132 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP19P09132 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRP19P09132 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRP19P09132 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SRP19P09132 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRP19P09132 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRP19P09132 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRP19P09132 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRP19P09132 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRP19P09132 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP19P09132 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP19P09132 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP19P09132 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP19P09132 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP19P09132 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP19P09132 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP19P09132 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP19P09132 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP19P09132 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP19P09132 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP19P09132 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP19P09132 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP19P09132 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP19P09132 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP19P09132 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP19P09132 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP19P09132 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP19P09132 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP19P09132 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP19P09132 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP19P09132 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP19P09132 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP19P09132 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP19P09132 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP19P09132 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP19P09132 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP19P09132 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP19P09132 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP19P09132 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP19P09132 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP19P09132 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP19P09132 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP19P09132 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP19P09132 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP19P09132 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP19P09132 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP19P09132 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP19P09132 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP19P09132 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRP19P09132 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRP19P09132 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRP19P09132 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SRP19P09132 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRP19P09132 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRP19P09132 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRP19P09132 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRP19P09132 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRP19P09132 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRP19P09132 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRP19P09132 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRP19P09132 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRP19P09132 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRP19P09132 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRP19P09132 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRP19P09132 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRP19P09132 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRP19P09132 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRP19P09132 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRP19P09132 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRP19P09132 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms