Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGF1P05230 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGF1P05230 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGF1P05230 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGF1P05230 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGF1P05230 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGF1P05230 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FGF1P05230 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGF1P05230 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGF1P05230 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGF1P05230 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGF1P05230 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FGF1P05230 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGF1P05230 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGF1P05230 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGF1P05230 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGF1P05230 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGF1P05230 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGF1P05230 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGF1P05230 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGF1P05230 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGF1P05230 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGF1P05230 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGF1P05230 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGF1P05230 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGF1P05230 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGF1P05230 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF1P05230 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF1P05230 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF1P05230 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF1P05230 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF1P05230 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF1P05230 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF1P05230 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGF1P05230 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGF1P05230 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGF1P05230 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGF1P05230 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGF1P05230 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGF1P05230 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGF1P05230 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGF1P05230 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGF1P05230 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGF1P05230 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGF1P05230 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGF1P05230 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGF1P05230 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGF1P05230 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGF1P05230 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGF1P05230 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGF1P05230 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGF1P05230 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGF1P05230 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGF1P05230 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGF1P05230 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGF1P05230 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF1P05230 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF1P05230 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF1P05230 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF1P05230 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF1P05230 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF1P05230 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF1P05230 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF1P05230 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF1P05230 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF1P05230 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGF1P05230 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGF1P05230 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGF1P05230 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGF1P05230 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGF1P05230 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FGF1P05230 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGF1P05230 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGF1P05230 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGF1P05230 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGF1P05230 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGF1P05230 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGF1P05230 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGF1P05230 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGF1P05230 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGF1P05230 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGF1P05230 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGF1P05230 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGF1P05230 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGF1P05230 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGF1P05230 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGF1P05230 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGF1P05230 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGF1P05230 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGF1P05230 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGF1P05230 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGF1P05230 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGF1P05230 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGF1P05230 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGF1P05230 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGF1P05230 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FGF1P05230 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGF1P05230 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGF1P05230 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGF1P05230 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms