Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A1P02730 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC4A1P02730 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC4A1P02730 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A1P02730 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A1P02730 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A1P02730 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms