Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYF2O95926 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYF2O95926 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYF2O95926 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYF2O95926 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYF2O95926 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYF2O95926 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYF2O95926 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYF2O95926 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYF2O95926 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYF2O95926 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYF2O95926 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYF2O95926 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYF2O95926 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYF2O95926 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYF2O95926 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYF2O95926 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYF2O95926 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYF2O95926 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYF2O95926 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYF2O95926 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYF2O95926 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYF2O95926 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYF2O95926 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYF2O95926 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYF2O95926 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYF2O95926 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYF2O95926 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYF2O95926 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYF2O95926 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYF2O95926 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYF2O95926 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYF2O95926 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYF2O95926 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYF2O95926 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYF2O95926 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYF2O95926 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYF2O95926 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYF2O95926 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYF2O95926 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYF2O95926 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYF2O95926 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYF2O95926 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYF2O95926 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYF2O95926 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SYF2O95926 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYF2O95926 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYF2O95926 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYF2O95926 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYF2O95926 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYF2O95926 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYF2O95926 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYF2O95926 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYF2O95926 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYF2O95926 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYF2O95926 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYF2O95926 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYF2O95926 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYF2O95926 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYF2O95926 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYF2O95926 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYF2O95926 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYF2O95926 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYF2O95926 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYF2O95926 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYF2O95926 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYF2O95926 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYF2O95926 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYF2O95926 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYF2O95926 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYF2O95926 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYF2O95926 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYF2O95926 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYF2O95926 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYF2O95926 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYF2O95926 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYF2O95926 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYF2O95926 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYF2O95926 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYF2O95926 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYF2O95926 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYF2O95926 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYF2O95926 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYF2O95926 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYF2O95926 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYF2O95926 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYF2O95926 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYF2O95926 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYF2O95926 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYF2O95926 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYF2O95926 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYF2O95926 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYF2O95926 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYF2O95926 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYF2O95926 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYF2O95926 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYF2O95926 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYF2O95926 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYF2O95926 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYF2O95926 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms