Protein–RNA interactions for Protein: O95255

ABCC6, Multidrug resistance-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC6O95255 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC6O95255 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ABCC6O95255 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ABCC6O95255 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ABCC6O95255 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ABCC6O95255 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ABCC6O95255 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ABCC6O95255 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ABCC6O95255 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ABCC6O95255 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ABCC6O95255 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ABCC6O95255 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ABCC6O95255 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC6O95255 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC6O95255 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ABCC6O95255 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCC6O95255 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCC6O95255 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ABCC6O95255 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCC6O95255 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCC6O95255 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC6O95255 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC6O95255 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC6O95255 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC6O95255 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC6O95255 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC6O95255 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC6O95255 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms