Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABARAPO95166 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GABARAPO95166 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GABARAPO95166 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABARAPO95166 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABARAPO95166 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABARAPO95166 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABARAPO95166 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABARAPO95166 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABARAPO95166 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPO95166 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPO95166 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPO95166 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPO95166 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPO95166 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABARAPO95166 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPO95166 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPO95166 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms