Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UPK1BO75841 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK1BO75841 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK1BO75841 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1BO75841 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1BO75841 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms