Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB3O75712 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB3O75712 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB3O75712 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB3O75712 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB3O75712 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB3O75712 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB3O75712 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB3O75712 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB3O75712 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB3O75712 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB3O75712 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB3O75712 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB3O75712 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB3O75712 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB3O75712 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB3O75712 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB3O75712 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB3O75712 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB3O75712 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB3O75712 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB3O75712 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB3O75712 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB3O75712 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB3O75712 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB3O75712 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB3O75712 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB3O75712 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB3O75712 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB3O75712 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB3O75712 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB3O75712 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB3O75712 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB3O75712 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB3O75712 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB3O75712 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB3O75712 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB3O75712 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB3O75712 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB3O75712 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB3O75712 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB3O75712 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB3O75712 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB3O75712 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB3O75712 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB3O75712 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB3O75712 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB3O75712 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB3O75712 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB3O75712 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB3O75712 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB3O75712 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB3O75712 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB3O75712 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB3O75712 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB3O75712 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB3O75712 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB3O75712 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB3O75712 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJB3O75712 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GJB3O75712 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB3O75712 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB3O75712 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB3O75712 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJB3O75712 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB3O75712 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB3O75712 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB3O75712 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJB3O75712 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJB3O75712 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJB3O75712 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJB3O75712 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB3O75712 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJB3O75712 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJB3O75712 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJB3O75712 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB3O75712 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GJB3O75712 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB3O75712 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB3O75712 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB3O75712 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB3O75712 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB3O75712 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB3O75712 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB3O75712 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB3O75712 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB3O75712 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB3O75712 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB3O75712 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB3O75712 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJB3O75712 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJB3O75712 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJB3O75712 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB3O75712 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB3O75712 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB3O75712 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB3O75712 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB3O75712 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB3O75712 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB3O75712 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms