Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRCH4O75427 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRCH4O75427 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRCH4O75427 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH4O75427 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRCH4O75427 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRCH4O75427 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRCH4O75427 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRCH4O75427 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms