Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEMFO60524 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEMFO60524 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEMFO60524 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEMFO60524 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEMFO60524 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEMFO60524 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEMFO60524 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NEMFO60524 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEMFO60524 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEMFO60524 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEMFO60524 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEMFO60524 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEMFO60524 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NEMFO60524 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NEMFO60524 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NEMFO60524 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEMFO60524 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEMFO60524 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEMFO60524 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEMFO60524 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEMFO60524 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEMFO60524 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEMFO60524 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEMFO60524 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEMFO60524 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEMFO60524 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEMFO60524 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEMFO60524 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NEMFO60524 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEMFO60524 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEMFO60524 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEMFO60524 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NEMFO60524 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEMFO60524 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEMFO60524 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEMFO60524 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEMFO60524 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEMFO60524 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NEMFO60524 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NEMFO60524 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEMFO60524 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEMFO60524 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEMFO60524 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NEMFO60524 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEMFO60524 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEMFO60524 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEMFO60524 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEMFO60524 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEMFO60524 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEMFO60524 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEMFO60524 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEMFO60524 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEMFO60524 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEMFO60524 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEMFO60524 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEMFO60524 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEMFO60524 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEMFO60524 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEMFO60524 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEMFO60524 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEMFO60524 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEMFO60524 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEMFO60524 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEMFO60524 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEMFO60524 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEMFO60524 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEMFO60524 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEMFO60524 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEMFO60524 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEMFO60524 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEMFO60524 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEMFO60524 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEMFO60524 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEMFO60524 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEMFO60524 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEMFO60524 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEMFO60524 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEMFO60524 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEMFO60524 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NEMFO60524 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEMFO60524 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEMFO60524 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEMFO60524 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEMFO60524 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEMFO60524 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEMFO60524 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEMFO60524 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEMFO60524 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEMFO60524 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEMFO60524 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEMFO60524 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEMFO60524 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEMFO60524 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEMFO60524 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEMFO60524 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEMFO60524 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEMFO60524 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEMFO60524 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEMFO60524 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms