Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENRO43583 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENRO43583 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENRO43583 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENRO43583 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENRO43583 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENRO43583 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENRO43583 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENRO43583 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENRO43583 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENRO43583 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENRO43583 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENRO43583 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENRO43583 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENRO43583 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENRO43583 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENRO43583 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENRO43583 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENRO43583 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENRO43583 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENRO43583 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENRO43583 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENRO43583 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENRO43583 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENRO43583 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENRO43583 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DENRO43583 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DENRO43583 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENRO43583 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENRO43583 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DENRO43583 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENRO43583 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENRO43583 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENRO43583 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENRO43583 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENRO43583 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENRO43583 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENRO43583 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENRO43583 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENRO43583 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENRO43583 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENRO43583 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENRO43583 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENRO43583 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENRO43583 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENRO43583 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENRO43583 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENRO43583 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DENRO43583 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENRO43583 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENRO43583 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENRO43583 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENRO43583 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DENRO43583 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENRO43583 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENRO43583 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENRO43583 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DENRO43583 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENRO43583 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DENRO43583 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENRO43583 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENRO43583 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENRO43583 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DENRO43583 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DENRO43583 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENRO43583 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENRO43583 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENRO43583 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DENRO43583 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENRO43583 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DENRO43583 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENRO43583 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENRO43583 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENRO43583 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENRO43583 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENRO43583 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENRO43583 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENRO43583 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENRO43583 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENRO43583 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENRO43583 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENRO43583 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENRO43583 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENRO43583 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENRO43583 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENRO43583 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENRO43583 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENRO43583 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENRO43583 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENRO43583 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENRO43583 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DENRO43583 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENRO43583 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENRO43583 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENRO43583 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENRO43583 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENRO43583 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENRO43583 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENRO43583 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENRO43583 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms