Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC26A4O43511 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC26A4O43511 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC26A4O43511 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC26A4O43511 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC26A4O43511 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC26A4O43511 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC26A4O43511 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms