Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKX2-8O15522 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX2-8O15522 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKX2-8O15522 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX2-8O15522 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX2-8O15522 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX2-8O15522 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX2-8O15522 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX2-8O15522 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX2-8O15522 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX2-8O15522 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX2-8O15522 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NKX2-8O15522 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms