Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PFDN6O15212 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PFDN6O15212 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFDN6O15212 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PFDN6O15212 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PFDN6O15212 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFDN6O15212 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms